李忠研究员主要从事鱼类遗传育种研究，在多年的工作取得了突出的成绩：一是作为第1完成人培育出四倍体异育银鲫“长丰鲫”，于2015年获得全国水产原种和良种审定委员会审定，该新品种目前已在湖北、四川、安徽、河北、广西、河南、陕西等地进行规模化推广示范，近3年推广示范过程中，在推广地区长势好，未见爆发性疾病出现，适宜在各地区养殖，具有广阔的应用前景。作为第2完成人培育出新品种“长丰鲢”，在全国27个省市（自治区）规模化养殖，取得了良好的社会和经济效益，该成果2013年获得了中国水产科学研究院科技进步一等奖。二是在理论创新方面，系统总结了利用雌核发育技术进行鲢新品种选育，着眼利用银鲫融合异源染色体组并协同发育的能力，为品种选育提供新的遗传材料和研究思路。相关理论均发表在Aquaculture杂志上。三是发表学术论文30篇（第一作者或通讯作者7篇，其中SCI论文4篇），以第1完成人获批发明专利3项。