主要从事进化基因组学和功能基因组学研究，建立应用适应性进化的理论来解析动物复杂性状遗传基础新的研究范式。这一范式的建立不仅解决了长期以来悬而未决的进化可预测性难题，而且为遗传学表型与基因型的研究提供了一条崭新的思路。利用这个研究范式，解决了哺乳动物回声定位、高原适应等复杂性状，并为生物多样性资源挖掘和可持续利用提供了新的研究驱动力。现任中科院先导B类项目“动物复杂性状的进化解析与调控”共同首席科学家。迄今，在Nature Genetics，Genome Research, Cell Research, PNAS, Molecular Biology and Evolution, Current Biology等国际著名期刊发表SCI论文39篇，总影响因子350，其中以（共同）通讯作者发表IF＞9以上论文9篇，完成2部国际著作中的特邀章节，发表的文章多次被 Science Now、Current Biology、Faculty of 1000 Biology等评注。论文共被引用2000余次，相关内容写入50多部国外著作。

现任中国遗传学会动物专业委员会委员，云南省遗传学会副理事长，《遗传》杂志编委会编委。曾应邀为Trends in Genetics, PNAS, Genome Research, PLoS Genetics, Molecular Biology and Evolution等21 个国际和国内知名期刊审稿。