La professeure Johanne Martel-Pelletier siège sur le bureau éditorial de plusieurs journaux scientifiques de recherche avec comité de pairs, a été éditrice invitée et coéditrice de plusieurs journaux ou revues scientifiques et éditrice de quatre livres. La professeure Martel-Pelletier a aussi été organisatrice et responsable du programme scientifique de congrès internationaux. Elle est très appréciée en tant que réviseure par de nombreuses revues spécialisées concernant la rhumatologie et les tissus conjonctifs, de même que par des organismes subventionnels pour la recherche au niveau national et international. Elle est également membre de plusieurs comités universitaires. Sa notoriété et son rayonnement se traduisent par plus de 450 publications, y compris des articles scientifiques, des revues et chapitres de livres et plus de 800 résumés de communication et présentations (plus de 220) en tant que conférencière.
Les travaux effectués dans son laboratoire ont permis une compréhension plus étendue des mécanismes physiopathologiques de l’arthrose. Son laboratoire a développé des concepts nouveaux et originaux sur l’arthrose qui ont permis la mise en place d’approches thérapeutiques axées non seulement sur les conséquences de cette maladie, mais également sur ses causes.