Die Forschung von Prof. Schön konzentriert sich auf die Optimierung von Züchtungsprozessen durch Integration molekularbiologischer Technologien. Das bedeutet vor allem den Einsatz molekularer Marker in der Züchtung von Nutzpflanzen. Dabei stehen die Charakterisierung der nativen Biodiversität und die Identifikation ihrer funktionellen Eigenschaften sowie die Entwicklung optimierter Zuchtstrategien für komplexe Merkmale im Mittelpunkt der Arbeiten.