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Imiracle: an Iterative Multi-View Graph Neural Network to Model Intercellular Gene Regulation from Spatial Transcriptomic Data
Ziheng Duan,Siwei Xu,Cheyu Lee, Dylan Riffle,Jing Zhang
CIKM '24 Proceedings of the 33rd ACM International Conference on Information and Knowledge Managementpp.538-548, (2024)
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ExAD-GNN: Explainable Graph Neural Network for Alzheimer’s Disease State Prediction from Single-cell Data
Ziheng Duan,Cheyu Lee,Jing Zhang
APSIPA transactions on signal and information processingno. 5 (2023)
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Venus: an Efficient Virus Infection Detection and Fusion Site Discovery Method Using Single-Cell and Bulk RNA-seq Data
Che Yu Lee, Yuhang Chen,Ziheng Duan,Min Xu,Matthew J. Girgenti,Ke Xu,Mark Gerstein,Jing Zhang
PLOS computational biology/PLoS computational biologyno. 10 (2022): e1010636-e1010636
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