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Divergent selection for feed efficiency in pigs altered the duodenum transcriptomic response to feed intake and its DNA methylation profiles
Guillaume Devailly, Katia Fève, Safia Saci, Julien Sarry,Sophie Valière,Jérôme Lluch,Olivier Bouchez,Laure Ravon,Yvon Billon,Hélène Gilbert, Juliette Riquet, Martin Beaumont,
Physiological genomicsno. 5 (2024): 397-408
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The benefits of long read HiFi sequencing for metagenomic analysis
Adrien Castinel, Jean Mainguy, Sylvie Combes,Carole Iampietro, Christine Gaspin, Denis Milan,Cécile Donnadieu, Claire Hoëde, Géraldine Pascal,Olivier Bouchez
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe) (2022)
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metagWGS: a workflow to analyse short and long HiFi metagenomic reads Taxonomic profile HiFi vs Short reads assembly
Joanna Fourquet, Jean Mainguy, Maïna Vienne,Céline Noirot, Pierre Martin, Vincent Darbot,Olivier Bouchez, Adrien Castinel, Sylvie Combes,Carole Iampietro,Christine Gaspin, Denis Milan,
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe) (2022)
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metagWGS: a workflow to analyse short and long HiFi metagenomic reads
Joanna Fourquet, Maïna Vienne, Jean Mainguy, Vincent Darbot, Pierre Martin,Olivier Bouchez, Adrien Castinel, Sylvie Combes,Carole Iampietro, Christine Gaspin, Denis Milan,Cécile Donnadieu,
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe) (2022)
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The benefits of long read HiFi sequencing for metabarcoding analysis
Adrien Castinel, Jean Mainguy, Sylvie Combes,Carole Iampietro, Christine Gaspin, Denis Milan,Cécile Donnadieu, Claire Hoëde, Géraldine Pascal,Olivier Bouchez
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe) (2022)
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metagWGS : a workflow to analyse short or long HiFi metagenomic reads
Joanna Fourquet, Maïna Vienne, Jean Mainguy, Vincent Darbot, Pierre Martin,Olivier Bouchez, Adrien Castinel, Sylvie Combes,Carole Iampietro, Christine Gaspin, Denis Milan,Cécile Donnadieu,
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe) (2022)
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Avancées réalisées en métabarcoding et en métagénomique dans le cadre du projet SeqOccIn grâce au séquençage longs fragments
Denis Milan, Jean Mainguy, Adrien Castinel,Olivier Bouchez, Sylvie Combes,Claire Hoede,Géraldine Pascal
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe) (2022)
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Strengths and limits of long read metabarcoding
Jean Mainguy,Adrien Castinel,Olivier Bouchez, Sylvie Combes,Carole Iampietro,Christine Gaspin, Denis Milan,Cécile Donnadieu,Claire Hoëde, Géraldine Pascal
HAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe) (2022)
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