长期致力于高性能计算、计算基因组学与医学生物信息学交叉科学领域的研究工作。先后承担了国家重点研发计划、国家自然科学基金、中国科学院战略性先导科技专项等10余项课题/项目，在Nature、Nature Genetics等国际重要科技期刊发表SCI检索论文62篇，被引用19000余次（H-index为32，Google Scholar数据）。代表性工作包括提出了基因组微卫星不稳定性(MSI)信号精准探测的新方法，形成了国际上具有核心地位的肿瘤样本多层次临床应用场景的MSI算法体系MSIsensor/MSIsensor2/MSIsensor-ct，并被成功应用于美国FDA批准的首个NGS肿瘤基因检测产品（MSK-IMPACT），同时被近期发布的2021版《结直肠癌分子检测高通量测序中国专家共识》所推荐。目前该系列算法被超过27个国家的670个临床研究项目所应用，支撑了超过30项具有重要国际影响的工作（Nature Reviews Cancer\Nature\Science\Cell），推动了肿瘤免疫治疗领域的研究进展，为人类癌症的精准诊治做出了一定贡献。曾获2015年美国10大临床研究成就奖（Top 10 Clinical Research Achievement Awards for 2015）。