东乡绿壳蛋鸡与白来航蛋鸡F2代资源群体鸡蛋蛋形指数性状变化规律及全基因组关联分析

本研究旨在分析鸡蛋蛋形指数变化规律,并探究影响该性状的候选基因,为其分子标记辅助选择提供参考依据.本实验利用由东乡绿壳蛋鸡和白来航蛋鸡构建的F2 代母鸡为素材,测定开产、32、36、40、44、48、52、56、60、66、72 周龄鸡蛋蛋形指数,分析其变化规律及遗传参数指标;同时提取基因组DNA,利用 600 K基因芯片进行全基因组关联分析(Genome-wide Association Study,GWAS).结果发现,周龄越大蛋形指数变异系数越大;各周龄蛋形指数遗传力在 0.19～0.37 之间,32～72 周龄间蛋形指数的遗传相关在 0.8以上,表型相关在0.4以上;在32、44、48周龄鉴定到与蛋形指数显著或潜在关联SNP位点8个,分别位于1、3、4 号染色体上;多变量GWAS分析鉴定到在 1、2、4 号和 17 号染色体上SNP位点 25 个与蛋形指数潜在关联,筛选到ZDHHC2、SCG2、COG5和GPR107等候选基因;其中以位于 4 号染色体ADHHC2基因内含子区域的rs317038353 位点对蛋形指数影响最大.综上,蛋形指数为中低遗传力,受微效多基因影响,其中ADHHC2为重要候选基因,研究结果为蛋形指数选择提供新的思路.