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5个乌骨鸡品种线粒体ND6基因遗传多样性及系统进化分析

Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica(2023)

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摘要
采用PCR扩增与核酸测序技术相结合的方法对 5 个乌骨鸡品种(丝羽乌骨鸡、东乡绿壳蛋鸡、金湖乌凤鸡、余干乌骨鸡和竹丝鸡)线粒体DNA的 ND6 基因全序列进行检测.结果表明:5 个乌骨鸡品种的 ND6基因序列全长为 522 bp,共计检测到 8 个核苷酸多态位点,界定 8 个单倍型,单倍型多样性、核苷酸多样性和平均核苷酸差异分别为 0.720±0.012、0.002 91±0.000 92 和 1.518.中介网络图分析显示,5 个乌骨鸡品种单倍型呈星状发散分布.系统发育分析发现,丝羽乌骨鸡单独聚为一支,其他品种乌骨鸡聚为一支.遗传距离分析表明,竹丝鸡和丝羽乌骨鸡遗传距离较远,母系来源不同.该研究结果为中国乌骨鸡遗传资源的种质保护、品种选育和鉴定工作提供参考.
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关键词
Mitochondrial DNA,Genetic diversity,Black bone chicken,Phylogeny
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