高通量测序分析六味地黄汤对肝肾阴虚型妊娠期便秘患者肠道菌群的影响

目的:采用高通量测序技术探讨六味地黄汤对肝肾阴虚型妊娠期便秘患者肠道菌群的影响.方法:选取肝肾阴虚型妊娠期便秘患者28例,分别于治疗前和服用六味地黄汤2周后收集其粪便标本各50 g,采用QIAamp DNA Stool Mini Kit试剂盒提取治疗前后粪便样本的总基因组脱氧核糖核酸(DNA),通过聚合酶链反应(PCR)扩增获得16S rRNA基因V4标签片段,构建Illumina平台文库并测序;采用定量分析微生物生态学(QI-IME)软件分析肠道菌群变化,绘制稀释曲线,分析治疗前后粪便样本生物信息学,进行Alpha多样性指数分析,并分别使用Chao1、Shannon及Simpson指数计算肠道菌群丰度和菌群多样性;采用LefSe技术分析治疗前后粪便样本中菌群组成中的差异性菌属.结果:稀释曲线表明测序数据量合理,基本能覆盖样本中所有的细菌种类;六味地黄汤治疗后患者肠道菌群的Chao1指数高于治疗前(P<0.05),但Shannon指数和Simpson指数在治疗前后比较,差异均无统计学意义(P>0.05);治疗前后患者肠道菌群在门水平中均以bacteroidetes、firmicutes和pro-teobacteria为优势菌群,治疗后在属水平肠道菌群共有10个菌属丰度发生明显改变,其中escherichia、alistipes、parabacteroides、bacteroides fragilis、coprococcus菌属丰度较治疗前明显降低,faecalibacterium、roseburia、bifidobacteri-um、prevotella、lactobacillus菌属丰度较治疗前升高(P<0.05).结论:妊娠期便秘患者服用六味地黄汤后,肠道内菌群结构改变显著,尤其在属水平有明显差异.