Padronização de metodologia crispr/dcas9 para identificação de integração de minicírculos de kdna de trypanosoma cruzi no genoma de células hospedeiras

Tatiana Shiroma Borges Ferreira, Izabela Marques Dourado Bastos Charneau,Mariana Machado Hecht

Anais do II Congresso Brasileiro de Parasitologia Humana On-line(2022)

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摘要
Introdução: A doença de Chagas (DC) é uma doença infecciosa causada pelo protozoário Trypanosoma cruzi. Estima-se que 6 a 7 milhões de pessoas estejam infectadas no mundo todo. Destes, aproximadamente 30% evoluem para a fase crônica sintomática, caracterizada pelo desenvolvimento de manifestações cardíacas, digestivas ou mistas. A integração de minicírculos de kDNA de T. cruzi no genoma hospedeiro é um dos fatores que pode influenciar na evolução da patogênese da DC. Diversos experimentos demonstraram a transferência de kDNA do parasito para os genomas de diferentes vertebrados. Na maioria dos casos, os minicírculos de kDNA estavam associados a retrotransposons do tipo LINE-1, permitindo a mobilização do kDNA para diferentes locais do genoma. Tais inserções poderiam resultar no surgimento de novas proteínas, na alteração da expressão ou, até mesmo, no silenciamento de genes. O sistema CRISPR/dCas9 representa uma plataforma promissora para complementar os estudos acerca da transferência gênica lateral. Esse sistema adaptado possibilita a geração de imagens de sequências específicas de DNA endógeno de células vivas, permitindo a visualização da organização e dinâmica de integração de kDNA nas células. Objetivos: Quantificar a população de células que contém as integrações no genoma ao longo de diferentes períodos de tempo e determinar se a presença do parasito é necessária para a propagação das integrações. Metodologia: Células HEK-293 serão infectadas com a cepa Y de T. cruzi e divididas em dois grupos, onde um deles receberá tratamento com Benznidazol. Os grupos serão transfectados com o sistema CRISPR/dCas9 utilizando RNAs guias voltados para sequências de minicírculos de kDNA, para regiões de LINE-1 e para uma sequência não direcionada ao genoma humano, que servirá como controle negativo. As transfecções serão analisadas por microscópio de fluorescência. Resultados: Até o momento, os resultados da transfecção com sgRNA de LINE-1 mostraram o bom funcionamento do sistema CRISPR/dCas9, bem como sua capacidade em reconhecer sequências repetitivas no genoma. Conclusão: Os resultados preliminares mostram que é possível rastrear o número de cópias de determinada sequência dentro da célula. Assim, a integração de kDNA de T. cruzi poderia ser monitorada durante toda a infecção, permitindo analisar a interação parasito-hospedeiro a nível celular.
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