基于生物信息学分析急性心肌梗死基因表达差异及中药干预

目的:通过基因表达数据库对正常人和急性心肌梗死患者的基因表达数据进行分析比较,筛选差异表达基因(DEGs),预测中医药治疗心肌梗死的潜在效果.方法:下载gse66360基因芯片,通过分析获得基因差异的表达信息,通过基因本体和京都基因与基因组百科全书分析DEGs,通过数据库和Cytoscape软件进一步分析关键基因,通过关键基因与医学本体信息检索平台的相互映射,筛选出治疗急性心肌梗死的潜在中药.结果:筛选出472个差异表达基因.生物学过程主要集中在髓系白细胞活化、细胞因子产生的调节和白细胞趋化性等.细胞成分主要集中在分泌颗粒腔和膜表面,膜的外在成分等.膜的分子功能为趋化因子受体结合和模式识别受体活性细胞因子结合;基因组百科全书分析显示,参与的主要信号通路为肿瘤坏死因子(TNF)、缺氧诱导因子-1(HIF-1)和JAK-STAT信号通路.筛选出的关键基因为fpr2和stat3、cxcl1、cxci8、ubr4、jun、ptafr、fcer1g、gpr84和plau,预测蜈蚣、姜黄和黄芩郁金、重楼、丹参、平贝母、人参等是干预急性心肌梗死的潜在中药.结论:活血化瘀药郁金、补气药人参、止咳平喘药贝母等有明显干预急性心肌梗死作用,其作用机制可能与调节免疫,抗炎通路相关.