线粒体12S与COI条形码对海洋鱼类的鉴定差异

Journal of Hainan Tropical Ocean University(2023)

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摘要
本研究基于145种常见海洋鱼类比较了使用12S与COI条形码鉴定物种的差异.结果如下:(1)145种鱼类共测得12S序列528条,所测鱼类基于12S条形码的种内遗传距离在0~0.006 8之间,最小种间遗传距离为0~0.416 2;有7种鱼类的种内遗传距离过大(大于0.005 5),且NJ系统发生树中存在不同鱼类聚于同一组内,种与种之间不分界的现象.(2)145种鱼类共测得COI序列686条,所测鱼类基于COI条形码的种内遗传距离在0~0.004 9之间,种间遗传距离均大于0.02,且至少为种内遗传距离的15.28倍;NJ系统发生树显示,各鱼类聚于不同组内,种与种之间分界明显.结果表明,基于12S基因的鱼类DNA条形码的物种鉴定存在物种注释假阴性或假阳性风险,应尽可能考虑使用COI条形码,以提高物种鉴定的准确性.
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