1株大鲵源葡萄牙柠檬酸杆菌的全基因组测定及毒力基因和耐药基因的分析

葡萄牙柠檬酸杆菌是一种新发现的条件性致病菌,为明确重庆地区大鲵源多重耐药葡萄牙柠檬酸杆菌的基因组及其耐药特征,本试验对患病大鲵分离菌进行鉴定、药敏试验、全基因组测序及毒力、耐药基因的分析.分离菌首先通过16S rDNA进行初步鉴定,腹腔注射健康小鼠观察其致病性;利用Kirby-Bauer(K-B)纸片法进行9类共35种抗生素的敏感性试验;再利用二代测序技术进行全基因组测序,通过生物软件和数据库对分离菌的毒力基因和耐药基因进行分析.结果显示,分离菌鉴定为葡萄牙柠檬酸杆菌,将其命名为CQ-CP1,该菌对小鼠具有较强的致病性.药敏试验显示CQ-CP1对多种抗生素不敏感,为多重耐药菌株.全基因组测序该菌株共有5 006 960 bp,G+C含量为51.8％,共编码有4 722个结构蛋白,基因组信息在GenBank中的登录号为RZIH00000000.1.病原毒力因子数据库(VFDB)比对发现CQ-CP1中共有49个与毒力相关的基因,与细菌的运动、黏附、转录等相关;耐药基因数据库比对结果显示,该菌携带6个耐药基因(ARG),分别是氨基糖苷类aad A1,喹诺酮类qnrS1、qnrB32,β内酰胺类blaCMY-35、blaTEM-1A和磺胺类dfrA1.本试验为葡萄牙柠檬酸杆菌的流行病学、致病性及耐药特征等研究提供参考.