泥蚶低氧胁迫后血细胞转录组及耐低氧相关基因的筛选与分析

泥蚶(Tegillarca granosa)是一种比较特别的具有较强耐低氧能力的贝类,但目前其耐低氧分子调控机理尚不知.为探究泥蚶耐受低氧的分子调控机理,本研究对低氧胁迫下的泥蚶(Tegillarca granosa)血细胞转录组中富集的信号通路及生物学过程进行分析,并初步筛选分析耐低氧基因.对低氧(DO=0.5 mg/L)胁迫6、24、72、120 h的泥蚶血细胞进行转录组测序(RNA-seq)并开展生物信息学分析,筛选出差异基因集,并对胁迫72、120 h的DEGs进行GO富集分析、KEGG通路分析,采用qPCR方法检测7个DEGs的表达量并与转录组比较.结果显示从6 h开始到120 h的4个时间点的DEGs数量呈增多的趋势,GO功能分析主要富集在JUN激酶活性的负调控、蛋白质水解的负调控及免疫系统进程等主动抗凋亡、抗逆进程;KEGG通路分析主要富集在胰岛素及胰腺分泌的信号通路、HIF-1通路、钙信号相关通路和细胞凋亡相关通路.qPCR检测结果显示,7个基因的表达上调/下调趋势与转录组测序一致,证实了转录组测序结果的可靠性.本研究推测胰腺分泌信号通路、钙信号通路及凋亡通路在泥蚶耐受低氧过程中发挥重要作用,与这些通路相关的JUN、PIM-3、TRIM45、MR-1B、CCKR在耐低氧过程中起到关键作用,可为以后贝类耐低氧的调控机理探究及耐低氧品系的分子选育提供参考.