旱敏感型与耐旱型高粱材料对干旱胁迫反应的转录组差异分析
wf（2022）
摘要
为从分子水平解析高粱干旱胁迫响应基因及其耐旱性的功能和通路,本研究以高粱干旱敏感材料L378和耐旱材料SX44B为试验材料采用盆栽人工干旱胁迫的方法,利用基于Illumina测序平台的第二代测序技术(next-generation sequencing,NGS),在24 h内对6个时间点的不同材料进行转录组分析.研究结果显示:敏感材料干旱胁迫响应基因8 928个,多于耐旱材料的4 032个,其中6个时间节点稳定表达数量分别为5 424个和822个,包括高表达响应基因共171个;不同基因型高粱对干旱胁迫的响应不同且主要涉及特定组的基因上调;根据差异基因GO功能富集分析敏感材料叶绿体部分在受到干旱胁迫时有更多活性氧可能引起较多的基因响应,高粱的耐旱性功能区别主要在于细胞膜的相关部分;次生代谢物生物合成中的苯丙素生物合成和渗透保护中的氰基氨基酸代谢可能是高粱耐旱性的主要KEGG通路.本研究通过2个不同材料对干旱胁迫响应的转录组分析,探讨高粱耐旱性的功能和通路,为高粱抗旱基因定位提供基础.
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