基于网络药理学与分子对接技术探究核桃楸皮治疗胃癌的作用机制
Shandong Chemical Industry(2022)
摘要
目的:本研究基于网络药理学与分子对接技术分析探讨核桃楸皮治疗胃癌的物质基础和作用机制.方法:首先通过文献挖掘得到核桃楸皮成分,并通过中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)获取对应成分参数,应用Swiss Target Prediction数据库预测活性成分的作用靶点.利用GeneCards、OMIM、TTD、DisGeNET数据库收集胃癌的基因靶点,将其与活性成分的预测靶点进行重复性筛选,交集靶点记为核桃楸皮治疗胃癌的潜在作用靶点.然后利用Cytoscape3.8.2构建"活性成分-靶点"网络,STRING数据库构建蛋白相互作用网络.根据拓扑分析筛选核桃楸皮治疗胃癌的关键活性成分与核心靶点,利用Sybyl软件对关键活性成分与核心靶点进行分子对接验证.应用DAVID数据库对潜在作用靶点进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果:结果显示核桃楸皮12个活性成分通过调控107个胃癌相关的疾病靶点,产生了333对活性成分-靶点关系,其中黄酮类化合物发挥重要作用,参与了cellular process等生物过程,干预PI3K-AKT等信号通路发挥治疗胃癌的作用.分子对接结果显示橙皮素、木犀草素等黄酮可与PTGS2等靶点成功对接,验证其相互作用.结论:本研究系统揭示了核桃楸皮治疗胃癌"活性成分-靶点"的复杂关系,以期更好地利用核桃楸皮资源并应用于癌症治疗与预防.
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