前列腺癌相关基因、癌组织差异表达基因及预后相关基因筛选

目的 筛选前列腺癌(PCa)相关基因、癌组织关键差异表达基因和预后相关基因,为PCa患者提供新的研究靶点.方法 选择GEO数据库中GSE104131数据集,对PCa组织基因进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),获得与PCa组织相关性最高的关键基因模块及与关键基因模块、PCa均高度相关的关键基因,然后对关键基因模块进行信号通路富集分析.基于GSE69223、GSE104131数据集,比较PCa组织及正常癌旁组组中的关键基因表达水平,筛选有统计学差异的关键基因(关键差异表达基因).最后基于GEPIA2数据库,对不同关键差异表达基因水平的PCa患者进行生存分析,筛选与PCa预后相关的基因.结果 WGCNA分析获得棕色模块为关键基因模块,其主要富集于内质网中的蛋白质加工通路;关键基因有14个,分别是P4HB、ERGIC1、FOXA1、RP11-498C9.2、HNRNPF、CANT1、SYNGR2、HID1、EIF2AK1、MARCKSL1、NME1、ST14、HPN、RAB3D;与正常癌旁组织比较,关键基因在PCa组织中表达水平均高(P<0.05),14个关键基因均为关键差异表达基因.P4HB、ERGIC1、RP11-498C9.2高表达较低表达的患者DFS更长,HNRNPF低表达患者较高表达的患者OS更长(P<0.05).P4HB、ERGIC1、RP11-498C9.2、HNRNPF为PCa预后相关基因.结论 PCa相关基因、癌组织关键差异表达基因均为14个,其中P4HB、ERGIC1、RP11-498C9.2及HNRNPF为PCa预后相关基因.