基于高通量测序的雪茄烟叶细菌多样性与功能预测

[背景和目的]环境条件与烟叶理化性质的改变直接影响烟叶的细菌群落结构和功能.为探究海南不同产区茄衣、茄套和茄芯细菌群落组成,研究雪茄烟叶细菌群落结构及代谢功能.[方法]以海南光村、昌江、白沙和五指山4个产区茄衣、茄套和茄芯为试验材料,基于16SrRNA测序技术分析细菌群落结构,PICRUSt预测分析细菌群落的代谢功能.[结果]12个样本中共聚类2317个OTU,属于10个科.五指山产区茄套的细菌群落丰富度及多样性最高,其Chao1指数、ACE指数和Shannon指数分别为344.00、344.00和6.54.光村和五指山产区细菌群落丰富度及多样性均表现为茄衣＜茄套、茄芯.昌江产区则表现为茄衣＞茄芯、茄套.茄衣的主要优势菌科为葡萄球菌科,相对丰度明显高于茄套、茄芯,不同产区之间无明显差异.茄套和茄芯的主要优势菌科为肠杆菌科,明显高于茄衣,且昌江、五指山＞光村、白沙.KEGG代谢通路分析结果表明,不同产区茄衣、茄套和茄芯细菌预测功能种类差异较小,丰度差异较大.[结论]在科分类水平上,不同产区不同用途雪茄烟叶细菌群落多样性丰富,细菌群落结构组成相似,相对丰度有所差异,葡萄球菌科、肠杆菌科是造成烟叶细菌群落结构差异的关键菌科.细菌群落代谢途径丰富,主要富集在碳水化合物代谢、氨基酸代谢和能量代谢通路中,除此之外,也较多的富集在辅助因子以及维生素代谢等通路.