基于生物信息学分析CSRP1基因在胃癌中的表达及其与免疫细胞浸润的关系

目的 基于肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库探讨CSRP1基因在胃癌中的表达及其与预后的相关性,并且分析CSRP1与免疫细胞浸润的关系.方法 采用生物信息学方法分析TCGA数据库中CSRP1在不同病理分期胃癌组织中的表达差异,使用Kaplan-Meier生存曲线分析其与胃癌患者预后的关系;将胃癌组织中与CSRP1共表达的基因进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,并在STRING数据库中对其编码的蛋白质进行蛋白相互作用分析;并分析CSRP1与免疫细胞的相关性.结果 CSRP1高表达胃癌患者的总体生存期较低表达患者短;随着肿瘤浸润程度的增加,T2～T4期胃癌患者CSRP1的表达增加,差异有统计学意义(P<0.05).单因素和多因素Cox分析显示,CSRP1、年龄、肿瘤浸润程度、淋巴结转移可作为胃癌独立的预后指标;CSRP1表达水平与CD4+T细胞、辅助T细胞、树突状细胞以及自然杀伤细胞的免疫浸润水平呈负相关(P<0.05).结论 CSRP1高表达胃癌患者的预后较差,可能和CSRP1影响肿瘤微环境中的免疫细胞浸润有关,表明CSRP1可能成为胃癌潜在的免疫治疗靶点.