粪便留取量对粪便中细菌结构和功能的影响

目的 探究不同粪便留取量对肠道菌群构成研究结果的影响,为肠道菌群构成研究中粪便样本的采集方式提供参考.方法 本研究分别对全便和部分粪便进行预处理,并使用PacBio SMRT测序技术对10名志愿者的20份粪便样本进行了 16SrRNA全长测序,通过多元统计学等手段对粪便中细菌的构成、多样性和功能进行比较分析.结果 Eubacterium rectale、Eubacterium ventriosum 和 Allisonella hista-miniformans等低丰度物种的相对丰度在不同粪便留取量中有一定差异,其在全便中的相对丰度均显著高于部分粪便(P＜0.05).但Wilcoxon配对检验发现粪便留取量对肠道菌群结构、多样性和功能的影响均无显著性差异(P＞0.05).不同个体间肠道菌群结构存在明显差异,且粪便留取量的影响远小于个体差异.结论 全便和部分粪便两种粪便留取量对检测微生物的组成、多样性和功能无显著影响,因此取部分粪便即可满足对肠道菌群研究的要求.