基于TCGA数据库探究膀胱癌关键基因的表达及预后作用

目的:探究膀胱癌(BC)中基因的差异化表达及其预后作用.方法:从TCGA数据库中下载BC的基因表达数据,利用R软件筛选出肿瘤与正常组织间差异表达基因,并进行富集分析,评估其潜在生物学功能及信号通路.利用在线数据库STRING11.0构建了编码蛋白相互作用网络,进一步筛选关键基因.通过UALCAN、GEPIA数据库验证关键基因在BLCA中的表达水平.随后利用在线工具Kaplan Meier Plotter分析他们的预后情况.结果:得到1538个基因存在差异表达,其中有1088个上调,450个下调,富集分析发现差异基因主要与信号转导、物质代谢、免疫反应等信号通路相关.10个关键基因中,在BC中白细胞介素-6表达越高预后越好(HR=0.46,P<0.05),间皮素表达越高预后越差(HR=2.27,P<0.05).结论:BC中存在众多差异表达的基因,他们对疾病进展存在影响,发现并利用他们在BC个体化治疗存在重要意义.