lncRNA HULC对肝癌细胞miRNA差异表达谱及ceRNA调控网络的影响

目的 探究长链非编码RNA(lncRNA)肝癌高表达转录本(HULC)对肝癌细胞微小RNA(miRNA)差异表达谱及竞争内源性RNA(ceRNA)调控网络的影响.方法 选取人肝癌细胞系BEL-7402,瞬时转染HULC siRNA以降低lncRNA HULC的表达.通过高通量测序选取表达具有差异的miRNA,并通过实时荧光定量PCR进行验证.基于参考基因组,预测新miRNA.通过基因富集分析及ceRNA调控网络,研究这些基因的潜在功能.结果 经敲低lncRNA HULC表达后,通过高通量测序挑选出了9个表达差异显著的miRNA.5个miRNA表达下调,4个miRNA表达上调.通过miRDeep2打分,挑选出了15个分值较高的新miRNA.基因富集分析结果显示,表达下调的miRNA的靶基因的分子功能与丝氨酸tRNA连接酶活性、蛋白激酶活性、阳离子通道活性、钙转运ATP酶活性等有关;表达上调的miRNA的靶基因与硒代半胱氨酸裂解酶活性、过氧化物酶体机制靶向信号1结合、过氧化物酶体靶向序列结合、蛋白质N-末端结合、肿瘤坏死因子受体超家族结合等有关.miRNA-靶基因互作网络、显著富集功能-功能互作网络揭示靶基因与miRNA的关联性以及功能间的相关性.结论 在肝癌细胞系BEL-7402中lncRNA HULC具有调节多个表达差异的miRNA的作用,通过ceRNA调控网络模式,影响肝癌的发生、发展.