Investigation d’une épidémie de leishmaniose cutanée chez des militaires, en Guyane française : aspects clinique, phylogénétique, épidémiologique, et environnemental

La leishmaniose cutanée (LC) est endémique en Guyane avec 200 à 300 cas/an, sporadique mais concentrée sur la saison des pluies. Les épidémies sont rares et peu investiguées. Un signal épidémique a été émis le 15/03/2020 avec 15 cas suspects de leishmaniose cutanée appartenant au 3 e Régiment étranger d’infanterie (REI) et 9 e Régiment d’infanterie marine (RIMA), et ayant participé à un stage d’entraînement en forêt équatoriale (CEFE). Une investigation épidémique était alors réalisée. Étaient définis comme cas, les militaires ayant participé au CEFE entre le 01/01/2020 et le 30/06/2020, avec des lésions compatibles et au moins un prélèvement positif ou une évolution favorable sous traitement anti-leishmanien de première intention. Une investigation sur site a été réalisée, ainsi qu’une description clinique et une phylogénie du gène HsP70. Une étude cas-témoin comparait les facteurs de risque individuels avec des stagiaires du CEFE sur la même période, non contaminés. Trente cas ont été confirmés. Leishmania guyanensis était l’espèce majoritairement trouvée. La présentation la plus fréquente était ulcéreuse (90 %), au niveau des membres supérieurs (63 %). Dix cas (33,33 %) ont présenté une mauvaise évolution clinique sous pentamidine et ont nécessité une 2 e ligne par amphotéricine B, dont trois ont nécessité une 4 e à 5 e ligne thérapeutique. Deux sites au sein du CEFE étaient à l’origine des contaminations, proches d’une activité de déforestation légale, et illégale. Les souches isolées ne constituaient pas un cluster à part. Vingt-deux cas et vingt-deux témoins ont répondu au questionnaire. La participation au CEFE pendant la 13 e semaine de 2020 est apparue comme facteur de risque de LC (OR = 4,59 ; IC 95 % : 1,1–19,8 ; p = 0,0159), mais aucun facteur comportemental n’a été mis en évidence. Le taux d’attaque du 9 e RIMA (14/105 = 13,3 % ; OR = 4,22 ; IC 95 % : 1,84–9,53, p = 0,0001) était plus élevé que celui du 3 e REI (16/507 = 3,16 %), comme celui des stagiaires du CEFE (30/858 = 3,5 % ; OR 2,29 ; IC 1,28–4,13 ; p = 0,0023) par rapport aux autres militaires de Guyane sur la même période (22/1427 = 1,5 %). L’absence de cluster génétique suggère une infection par de nombreux phlébotomes et de réservoirs sur les sites déforestés, au cours d’une période climatique plus à risque. La participation au CEFE apparaît comme un facteur de risque de LC, mais aucun facteur comportemental n’est ressorti. Les évolutions cliniques défavorables laissent craindre l’émergence de souches résistantes aux traitements.