肝癌相关hsa-miR-483-5p的靶基因预测及生物信息学分析

目的 通过生物信息学分析方法预测miR-483-5p的靶基因和信号通路,为进一步分析其在肝癌发生、发展中的调控机制提供理论依据.方法 利用starBase靶基因数据库预测hsa-miR-483-5p靶基因集,利用STRING数据库和Cytoscape软件构建miRNA潜在靶点蛋白质相互作用(PPI)网络图,再将预测的靶基因利用软件R3.6.3进行基因本体(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析.结果 hsa-miR-483-5p预测的靶基因一共278个.GO功能富集分析结果显示,hsa-miR-483-5p的靶基因主要富集在细胞的焦点粘连、细胞基质黏着小带、细胞-基质结等细胞组分;参与蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性等分子功能(P值均＜0.05).KEGG信号通路富集分析表明,hsa-miR-483-5p的靶基因信号通路显著富集在焦点粘连通路和胰岛素信号通路(P值均＜0.05).其中,MAPK1和MAPK3同时出现在所有的细胞组分、分子功能和信号通路中,处于信号转导网络的核心位置.结论 hsa-miR-483-5p可能通过靶基因参与多种生物学过程,推测其在肝癌中的作用可能与MAPK1和MAPK3的调控密切相关.