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1株鸽源基因Ⅶ型新城疫强毒株的分离鉴定及全基因组分析

Chinese Journal of Veterinary Medicine(2020)

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摘要
为进一步了解新城疫病毒(NDV)的遗传进化规律,从疑似NDV感染的鸽群中通过鸡胚接种分离出1株新城疫强毒株,将其命名为Pigeon/China/SHJD13/2017,经噬斑纯化后测定其鸡胚平均死亡时间(MDT)为57.2 h,1日龄雏鸡脑内致病指数(ICPI)为2,毒力指标属于强毒NDV.参考GenBank公布的NDV全基因组序列,共设计了11对引物,对其进行全基因组测序,序列测定结果显示:分离株属于基因Ⅶ型NDV,其基因组全长15 192 bp,登录号为MK937786,F基因共包含553个aa,裂解位点的氨基酸残基为112R-R-Q-K-R-F117,符合NDV强毒株的分子特征.通过序列同源性比对分析,该分离株与鸡源强毒株Chicken/China/SDWF07/2011亲缘关系较近,表明该鸽源分离毒株可能来自于感染的鸡群.
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