鸡胚卵巢基因共表达网络模块的构建及功能分析

REN Yifan,MENG Jie,YANG Qing,ZHANG Bei,LI Keqiang,ZHANG Chuansheng,GENG Liying,ZHAO Xueyan,LI Xianglong

Journal of Hebei Normal University of Science & Technology（2021）

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摘要

为构建鸡胚卵巢的基因共表达网络模块,挖掘鸡卵巢发育相关功能基因,通过加权重基因共表达网络分析(WGCNA),利用鸡胚卵巢转录组测序数据构建了共表达模块,并对模块进行生物学过程、KEGG通路和蛋白互作网络分析,筛选出与鸡卵巢发育密切相关的枢纽基因.结果表明:共鉴别出8个共表达模块,对其中6个模块进行富集性分析并选出2个特征性模块:青色和红色,选出模块的候选枢纽基因进行蛋白互作网络分析并筛选出2个模块的枢纽基因,分别是:CDCSL和PLG;并从鸡两侧卵巢发育角度对2个模块进行了功能分析.

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