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一起高校多基因型诺如病毒感染暴发疫情的病原特征分析

Disease Surveillance(2022)

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摘要
目的 分析2020年一起急性胃肠炎暴发疫情中诺如病毒基因特征,为加强学校诺如病毒感染暴发疫情防控提供依据.方法 收集2020年9月2-10日甘肃省某高校一起诺如病毒感染暴发疫情中有呕吐腹泻症状在校人员的232份粪便标本,初步采用实时荧光PCR法进行初筛和基因组鉴定,随后采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)对诺如病毒阳性标本扩增,对Ct值小于35的扩增产物进行部分聚合酶区和衣壳区序列测定,采用MEGA-X软件以邻接法构建系统进化树并进行遗传进化分析.结果 2020年该高校急性胃肠炎暴发疫情涉及患者的症状体征以腹泻(92.55%)、腹痛(88.94%)、呕吐(87.66%)和恶心(78.09%)等为主,由诺如病毒G Ⅰ、GⅡ型混合感染引起,232份粪便标本中诺如病毒检出率77.59%(180/232),其中G Ⅰ检出率 16.38%(38/232),GⅡ 检出率44.83%(104/232),GⅠ、GⅡ 混合感染 16.38%(38/232).截止2020年9月 10日 18:00,共有470名学生发病,就诊以轻症患者居多,其中33人入院观察治疗.测序结果显示该疫情基因型别为GⅠ.3[P10]、GⅠ.3[P13]、GⅠ.5[P4]、GⅡ.10[P16]、GⅡ.17[P17]、GⅡ.22[PNA5]、GⅨ.1[GⅡ.P15].结论 该高校急性胃肠炎疫情中诺如病毒病原基因型呈现7个型别,前3位依次为GⅡ.22[PNA5]、GⅠ.3[P13]、GⅨ.1[GⅡ.P15],需进一步加强甘肃省诺如病毒病原监测水平及基因型分析工作.
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关键词
multi genotype norovirus,acute gastroenteritis epidemic
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