Covid-19 à Mayotte : profil épidémiologique d'une année de crise

Introduction Le 13/03/20, Mayotte declare son premier cas de Covid-19. Le contexte socio-economique precaire rend inconcevable l’application des recommandations de prevention. Bien que la moitie de la population ait moins de 18 ans ; chez les adultes, la prevalence des facteurs de risque de formes graves fait redouter une saturation de l’unique hopital de l’ile : 38 % d’HTA, 12 % de diabete tandis que l’IMC moyen est de 26,9 kg/m2. Materiels et methodes Afin de comprendre la dynamique et la severite du Covid-19 a Mayotte, plusieurs dispositifs de surveillance ont ete mis en place. Ce travail decrit l’evolution epidemique du 9/03/20 au 14/03/21 en distinguant deux vagues differentes du fait de l’emergence de variants: 2020 (9/03/20-31/12/20) versus 2021 (01/01/21-14/03/21). Resultats L’epidemie a debute en mars 2020 avec un pic en mai (taux d’incidence (TI) de 133/100000 hbts). L’âge median des cas etait de 36 ans et la plupart d’entre eux etait sans activite professionnelle. Le TI a diminue pour passer debut juillet, sous le seuil d’alerte, suggerant une accalmie durant l’hiver austral. Cette premiere vague s’est averee relativement peu severe avec un maximum de cas hospitalises en S21 : 51 patients hospitalises dont 11 en reanimation. La circulation virale a continue sans impact sanitaire majeur jusqu’en decembre 2020 ou l’Afrique du Sud a signale l’emergence du variant 501Y.V2. Quelques semaines apres les Comores, Mayotte enregistrait une degradation rapide et intense de la situation: doublement du TI, triplement du taux de positivite Sars-Cov-2 (TP) entre mi-decembre et mi-janvier, y compris chez les 0-14 ans. En S6-2021, le TI a atteint un pic (894/100000 hbts) tout comme le TP culminant a 28 %. Deux enquetes flash en fevrier ont montre la part majoritaire d’un variant avec la mutation 501Y, representant 87 % (150/172) des echantillons analyses par criblage. Les indicateurs hospitaliers temoignaient de la severite de cette nouvelle vague avec un pic atteint en S18-2021 : 148 patients hospitalises dont 27 en reanimation, majoritairement des formes oxygeno-requerentes. En 2021, 149 cas ont ete admis en reanimation contre 104 en 2020 (sex ratio H/F = 1,9). Parmi les patients presentant une forme pulmonaire, le profil des cas admis en reanimation en 2021 a change par rapport a 2020 : ils etaient significativement plus jeunes (57 vs 62 ans) et presentaient un profil de comorbidites different. Au total, en un an, 18899 cas ont ete confirmes biologiquement et 253 patients admis en reanimation: ils correspondaient a 203 cas de formes pulmonaires, 46 cas de portage asymptomatique et 14 cas de syndrome inflammatoire multi-systematique associe a une infection par le Sars-Cov-2. En 2021, 88 patients sont decedes contre 55 en 2020; âges medians respectifs de 73 et 64 ans. Conclusion Le confinement de fevrier 2021 s’est suivi d’une inversion de la tendance epidemique. Fin mars, l’epidemie se poursuit avec un TI de 63/100000 hbts. Alors que moins de 5000 personnes ont ete vaccinees a deux doses, la vigilance est de mise pour ce territoire vulnerable.