Multi-Dimensional Statistical Analysis of Spatial Structures of DNA in Interfaces Complexes of Homeodomain-DNA Family: Helical Parameters

Изучение строения семейства комплексов гомеодомен -ДНК и классификация комплексов белок-ДНК и их интерфейсов по физико-химическим, геометрическим параметрам связана с решением ряда задач вычислительного и статистического характера.В данной работе представлены результаты анализа спиральных параметров ДНК в интерфейсах 75 комплексов семейства гомеодомен -ДНК.Цель работы -исследовать взаимосвязь комплексов друг с другом, иметь возможность проследить их эволюцию и дать основу для формулировок правил узнавания и построения моделей узнавания.Для анализа данных мы используем методы многомерного статистического анализа: для проверки гипотезы независимости признаковкритерий Спирмена; ANOVA, непараметрического дисперсионного анализа -тест Крускала-Уоллиса, медианный критерий Брауна -Муда, которые показали, что структура комплекса не влияет на геометрические параметры ДНК; методы кластерного и дискриминантного анализа.Кластерный анализ разбил исходную выборку на три однородные группы