Identifizierung von Chemokinliganden durch biochemische Rezeptorfragmentierung und simulierte Peptidevolution

Kurzkettige Peptide können gewisse Nachteile niedermolekularer Inhibitoren von Protein‐Protein‐Interaktionen (PPIs) überwinden. Wir untersuchten die Interaktion zwischen dem humanen Chemokin CCL19 und dem Chemokinrezeptor CCR7, um rezeptorabgeleitete CCL19‐bindende Peptide zu entwerfen. Die Identifizierung einer linearen Bindestelle von CCR7 und der nachfolgende Pharmakophor‐ und Lipophilie‐basierte Entwurf von computergenerierten Peptidbibliotheken führten zu fünf Hexapeptiden mit Affinitäten zu CCL19 im niedrigen mikro‐ bis nanomolaren Bereich. Dieses Ergebnis bestätigt die Anwendbarkeit des Computerverfahrens zur Findung von Peptid‐PPI‐Liganden.