宏基因二代测序在儿童血流感染中的应用

China Tropical Medicine(2021)

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摘要
目的 分析宏基因二代测序(metagenomics next-generation sequencing,mNGS)技术在儿童发热血流感染中的诊断价值,并为临床合理调整治疗方案提供依据.方法 选择2019年1月-2020年3月在海口市人民医院儿科住院治疗的25例临床疑似血流感染的患儿,分别留取标本进行血培养和mNGS病原体检测.比较两种技术的病原体检出结果及阳性率.结果 25例患儿中,血培养检测平均报告时间为3.7 d,检出病原体阳性1例,阳性率为4.0%;mNGS病原检测平均检出报告时间2.3 d,检出病原体阳性13例,阳性率为52.0%,差异有统计学意义(P<0.05).血培养检出病原体1种,mNGS检出病原体16种,mNGS检出的病原体种类和数量明显高于传统病原学检测.在mNGS检测出阳性的13例患儿中,单一病原体感染6例,多重病原体感染7例,经结合患儿人院前后诊疗情况,采信其中10例结果,维持或调整抗感染治疗方案;另外3例患儿检出不同种类的真菌,考虑与临床表现及相关检查不符,不予采纳检测结果,遂未加用抗真菌药物予以治疗.13名患儿经过积极综合治疗,均痊愈出院.结论 宏基因二代测序有助于协助部分发热儿童血流感染的病原学诊断.
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