睾素基因家族在卵巢癌组织中的表达及其临床意义的生物信息学分析

目的:通过生物信息学方法分析睾素基因家族(sparc/osteonectin,cwcv and kazal-like domains pro-teoglycan,SPOCK)在卵巢癌组织中的表达及临床意义.方法:利用GEPIA和UALCAN数据库比较及验证SPOCK在正常卵巢组织及卵巢癌组织中的表达差异;利用GEPIA数据库评价SPOCK2表达对卵巢癌患者预后的影响;利用GeneMANIA网站预测SPOCK2的蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络;利用DAVID对SPOCK2及其关键的互作基因进行基因富集(gene ontology,GO)分析和通路富集(kyotoencyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析.结果:在GEPIA数据库中,与正常卵巢组织相比,SPOCK2在卵巢癌组织中显著上调,而SPOCK、SPOCK3无显著差异表达.通过CPTAC数据库进一步确认SPOCK2蛋白水平在卵巢癌组织中高表达;此外,SPOCK2高表达患者的总生存率(overall survival,OS)均明显低于SPOCK2低表达患者.蛋白质互作网络分析揭示了包括SPOCK3、PLXNB3在内的20个关键互作分子;GO分析和KEGG分析揭示了SPOCK2及其关键互作分子的潜在分子机制.结论:SPOCK2在卵巢癌组织中高表达,且与卵巢癌的发生、发展及预后密切相关,可以作为卵巢癌诊断、预后预测的标志物之一.