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贵州地方红米品种的遗传多样性分析

Seed(2021)

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Abstract
利用分布于水稻12条染色体的56对SSR标记对来自贵州省内的147份地方红米水稻种质进行遗传相似性和遗传多样性研究.共检测到147个等位基因,品种间不同位点的等位基因数(Na)变幅为2~5个,平均2.6429个;有效等位基因数(Ne)变幅为1.0346~3.9788个,平均1.7585个,有效等位基因所占比例为66.5%;Nei's基因多样性指数(He)变幅为0.0334~0.7487,平均为0.3549;Shannon信息指数(I)平均为0.6046,变幅为0.0861~1.4714;多态性信息含量(PIC)平均为0.3694,变幅为0.0400~0.7487.UPGMA聚类分析结果显示,在遗传相似系数为0.55的水平上,可将供试材料聚为两大类,其中第Ⅰ类涵盖的品种有140个,占供试材料总数的95.24%,但在所检测的位点中没有基因型完全相同的品种.结果表明,贵州地方红米品种的遗传多样性水平较低,遗传基础较狭窄,应加强种质交流,拓宽贵州地方红米种质遗传基础.
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