采用诱导环化酶制备Illumina Mate-paired DNA文库

Genomics and Applied Biology(2019)

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摘要
新一代测序技术(NGS)的文库制备方法在基因组的拼装中起着重要作用.但是NGS技术制备的普通DNA文库片段只有500 bp左右,难以满足复杂基因组的从头(如novo)拼装要求.三代测序技术的读长可以达到20 kb,但是其高错误率及测序成本过高使得其又不易推广.因此二代测序的Mate-paired文库制备技术一直在基因组的de novo拼装中扮演着非常重要的角色.目前主流的NGS平台Illumina制备的Mate-paired文库的片段范围只有2~5 kb,为了得到更长的可用于Illumina平台测序的Mate-paired文库,本研究首次整合并优化了Illumina和Roche/454两种测序平台的Mate-paired文库制备技术,采用诱导环化酶来提高基因组长片段DNA的环化效率,成功建立了20 kb Mate-paired文库制备技术,并己将该技术应用于人类基因组20 kb Mate-paired文库制备.该技术为Illumina平台制备长片段Mate-paired库提供了方法指导.
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