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猪ANK1新的可变剪接体功能预测、组织表达谱分析与真核表达载体构建

Genomics and Applied Biology(2017)

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摘要
为进一步了解猪ANK1基因,本研究以广西巴马猪作为实验对象,分析ANK1基因结构与功能,并利用实时荧光定量PCR方法,分析ANK1基因在广西巴马小型猪1 1个不同组织(心脏,肝脏,脾脏,肺脏,肾脏,大肠,小肠,胰腺,皮下脂,胃,背最长肌)中的表达水平.组织表达谱分析结果表明ANK1基因在11个组织中均有表达,mRNA表达量表现为:胰腺>心脏>背最长肌>胃>大肠>肝脏>肾脏>小肠>脾脏>肺脏>脂肪.ANK1基因编码的蛋白通过生物信息学分析表明,编码156个氨基酸,存在跨膜结构和跨膜信号肽,分子量为17 799.27,理论等电点6.31,α螺旋和无规则卷曲所占比例比较大.通过酶切技术成功获得pEGFP-AN-K1重组质粒并转染到C2C 12细胞中,于48h拍照发现细胞发出荧光,说明ANK1基因真核表达载体构建成功.
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关键词
Porcine,ANK1 gene,Eukaryotic expression vector,Bioinformatics,Expression profile
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