B亚型HIV-1 V3区氨基酸变化与病毒感染能力及亲嗜性的研究

目的 通过分析不同嗜性B亚型HIV-1感染者V3区氨基酸序列差异及感染实验,探讨V3区11、22和25位点与病毒感染能力及亲嗜性的关系.方法 从HIV数据库中以FASTA格式下载B亚型V3区氨基酸序列,并将其分为CCR5亲嗜性组和CXCX4亲嗜性组,利用CLUSTAL W软件分别对两组序列进行多重序列比对,计算每个位点氨基酸出现的频率,并进行降幂排列.对HIV-1 HXB2和SF162株包膜糖蛋白V3区进行修饰,构建伪病毒及进行感染实验.结果 研究结果显示,R5亲嗜性和X4亲嗜性病毒中V3区Consensus序列在11、22和25位上有差别.在R5亲嗜性毒株中这三个位点最常出现的氨基酸频率分别为71.9％S、66.7％A和56.0％ D;在X4亲嗜性毒株中这三个位点最常出现的氨基酸频率分别为50.0％R、57.1％T和26.2％Q.V3区22氨基酸残基与病人CD4+T细胞数具有明显的相关性.R5亲嗜性或X4亲嗜性毒株V3区11、22和25位氨基酸残基的改变都使其感染能力降低,并且SF162的11位氨基酸残基S转变为R时,病毒由R5嗜性变为R5X4双嗜性.结论 B亚型的HIV-1中V3区22位氨基酸残基与病毒的感染能力及病人的疾病进展具有明显的相关性,可以和11、25位氨基酸一起作为生物学表型预测的位点.