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抑制差减杂交克隆E1 Tor霍乱弧菌流行株与非流行株基因组差异片段及其分析

CHINESE JOURNAL OF BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY(2002)

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摘要
为了克隆与分析霍乱弧菌O1 E1 Tor流行株与非流行株两类菌株基因组差异片段,采用抑制差减杂交技术(suppression subtractive hybridization,SSH)分别以国内保留的流行株Wujiang~2及非流行株Js-32一株作为被检菌,另一株作为参考菌进行基因组差异研究.在进行的差减杂交实验中,流行株Wujiang-2共检出34个特异差异片段,经同源检索共代表35个基因片段,其中包括许多重要的霍乱弧菌毒力相关基因如CTXφ遗传单元、TLC因子及可移动外来成分如霍乱弧菌整合子RVC序列及Tn10转位酶.非流行株Js-32共检出14个特异差异片段,经同源检索未能检出同源片段,可能代表新基因序列.研究表明,霍乱弧菌流行株与非流行株基因组存在较多差异基因,表现在毒力、毒力相关基因、代谢以及其它噬菌体等可转移的基因成分.
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关键词
nonepidemic strains,genomic differential fragments
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