MSAP荧光检测初始数据的自动分析研究

目的：建立能够实现甲基化敏感扩增多态性（MSAP）荧光检测初始数据自动分析的方法。方法：以17周龄的北京油鸡为实验材料，应用荧光标记的MSAP方法对肌肉组织基因组DNA甲基化水平进行检测，对获得的MSAP荧光检测初始数据通过直接取整法、整区间放置法和半区间放置法等3种计算机处理方法进行分析和比较。结果：对于MSAP荧光检测初始数据的自动转换，半区间放置法与标准的人工转换方法最接近（P>0.05），整区间放置法次之（P>0.05），而直接取整法与标准的人工转换方法差异最大，达到显著水平（P<0.05）。结论：整区间放置法和半区间放置法适用于MSAP荧光检测初始数据的自动分析，建立了基于半区间放置法的在线自动分析软件MSAP Analyst，可实现MSAP荧光检测初始数据的自动分析。