2018-2019年云南省昭通市A型流感病毒基因特征分析

目的 分析2018-2019年云南省昭通市新甲型H1N1、H3N2亚型流感病毒流行情况及基因进化特征,为流感防控提供科学依据.方法 收集2018年1月-2019年10月昭通地区哨点医院流感样病例咽拭子标本2 863份进行real-time RT-PCR检测,用狗肾传代细胞(Madin-Darby canine kidney cell,MDCK)对核酸阳性样本进行病毒分离,分离得到的流感毒株采用血凝抑制实验进行鉴定分型.最终选取43株新甲型H1N1亚型流感毒株,及15株H3N2亚型毒株进行全基因组测序,使用MEGA 5.2软件进行序列分析.结果 系统发生分析表明95.35％(41/43)昭通新甲型H1N1分离株属于6B.1A支系,93.33％(14/15)H3N2分离株属于3C.2a1b支系.与参考株A/California/07/2009相比,新甲H1N1分离株HA蛋白有7处抗原位点和1处受体结合位点发生变异,H3N2分离株有5处抗原位点和4处受体结合位点发生变异.结论 2018-2019年昭通地区流行的新甲型H1N1和H3N2亚型流感病毒毒株与WHO推荐的当年北半球的疫苗组分匹配,但H3N2亚型与WHO推荐的2019-2020年H3亚型疫苗株发生偏离,需加强监测.