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2018-2019监测年度云南省流感病毒分子流行病学特征分析

Modern Preventive Medicine(2020)

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摘要
目的 了解2018-2019监测年度云南省流感病毒流行趋势及其基因分支特征,为此后的防控提供科学依据.方法 对2018-2019年采集的20 979份流感样病例鼻咽拭子使用Realtime RT-PCR方法筛选流感病毒阳性样本,使用MDCK进行阳性标本病毒分离,SPSS软件进行数据分析.随机选取各亚型流感病毒共80株进行NGS测序,使用MEGA 5.0进行序列分析.结果 监测年度流感样病例样本中共检测出2 657份流感阳性标本,阳性率为12.67%(2657/20 979),其中甲型H1N1占70.49%(1 873/2 657),H3占21.12%(563/2 657),By亚型占4.52%(120/2 657),By亚型占3.80%(101/2657).流感病毒阳性检出率男性12.72%,女性12.60%,不同性别阳性检出率差异无统计学意义(x2 =0.063,P=0.587),各年龄组阳性检出率中,46~ 60岁组最高(15.73%),5个年龄组阳性检出率差异有统计学意义(x2=20.748,P<0.001),不同职业中工人阳性检出率最高(15.65%),4种不同职业间阳性检出率差异有统计学意义(x2 =20.167,P<0.001),咽拭子检出率低于其他类型样本,不同样本类型阳性检出率差异有统计学意义(x2=36.161,P<0.001),全年冬季出现1个流感高峰(12月至次年2月),不同月份阳性检出率差异有统计学意义(x2=2119.964,P<0.001).甲型H1N1亚型流感病毒均属于6B.1A支系,H3N2亚型季节性流感病毒包括了3C.2a分支内的所有分支类型,By系流感毒株均属于Victoria 1A支系,By系流感毒株均属于Yamagata第3支系.结论 2018-2019监测年度云南省主要以甲型H1N1为主,H3亚型与B型病毒共流行的流行特点.各亚型流感病毒与疫苗株匹配情况较好,基因序列未发生重大改变.
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