南京地区诺如病毒GⅡ.Pe-GⅡ.4基因特征

目的 研究南京地区诺如病毒GⅡ.Pe-GⅡ.4基因特征和变化规律,了解其进化过程及高变区氨基酸变化情况,预测进化方向及流行趋势,为疫情预警和处置提供科学依据.方法 应用荧光定量PCR和一步法RT-PCR,对南京地区2014-2017年分离的10株GⅡ.Pe-GⅡ.4的部分聚合酶一衣壳蛋白区及P2区进行测序,并利用分子生物学软件对序列进行比对分析.结果 进化树分析发现,2014-2015年和2016-2017年南京流行株分别位于两个簇.氨基酸分析显示,10株南京流行株同源性达97.3％～100.0％,与21株国内外2011-2017年参考株同源性达97.1％～100.0％.与2008年前驱期澳洲株(KX789174) P2区相比较,10株南京株共19个氨基酸位点发生改变,其中10个位点位于5个抗原表位.南京株2016年后抗原表位A区有氨基酸位点改变.结论 2014-2017年南京地区分离的诺如病毒GⅡ.Pe-GⅡ.4基因型流行株氨基酸同源性较高,但仍呈现出随时间迁移某些抗原位点的氨基酸改变,应持续观察其进化趋势.