我国不同利什曼病流行区利什曼原虫分离株核糖体内转录间隔区1的多态性分析

目的 分析我国不同利什曼病流行区的利什曼原虫分离株核糖体内转录间隔区1(ITS-1)序列的多态性. 方法 实验室培养10个分离自我国不同利什曼病流行区的利什曼原虫分离株,包括四川/甘肃山丘型内脏利什曼病流行区的SC6和Cy分离株,新疆喀什人源型内脏利什曼病流行区的801和KS-2分离株,新疆伽师荒漠型内脏利什曼病流行区的JIASHI-1、JIASHI-5、XJ771分离株以及新疆克拉玛依皮肤利什曼病流行区的KXG-Xu、KXG-Hu和KXG-927分离株.收集利什曼原虫前鞭毛体,提取DNA,PCR扩增各利什曼原虫分离株的ITS-1并送测序,用GENEDOC软件对ITS-1序列进行比对分析,从GenBank下载利什曼原虫其他分离株的ITS-1序列,构建系统进化树,分析我国利什曼原虫分离株的亲缘关系. 结果 我国10个利什曼原虫分离株均扩增出单一的条带.序列分析结果显示,801和KS-2分离株的ITS-1片段为316 bp,与MHOM/IN/80/DD8参照株比较其碱基突变率为0;JIASHI-1、JIASHI-5和XJ771分离株为313 bp,碱基突变率为1.6％;KXG-Xu、KXG-Liu和KXG-927分离株为312 bp,碱基突变率为1.6％;Cy和SC6分离株为318 bp,碱基突变率为0.6％.系统进化树显示,这10个利什曼原虫分离株ITS-1序列聚集成2个群和3个亚群,其中JIASHI-1、JIASHI-5和XJ771分离株聚集为A亚群,KXG-Xu、KXG-Liu和KXG-927分离株聚集为B亚群,A和B亚群聚集于群I,为婴儿利什曼原虫;Cy、SC6、801和KS2分离株聚集为C亚群,属群Ⅱ,为杜氏利什曼原虫. 结论 我国不同利什曼病流行区的利什曼原虫分离株的ITS-1序列存在多态性.