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腹膜间皮细胞转分化小鼠模型差异表达长链非编码RNA的筛选及意义

Shandong Medical Journal(2018)

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Abstract
目的 筛选高糖诱导腹膜间皮细胞转分化小鼠模型中差异表达长链非编码RNA(lncRNA),分析其作用.方法 将20只C57BL/6雄性小鼠随机分为对照组和模型组,每组10只.对照组正常饲养4周,模型组给予4.5%高糖腹膜透析液腹腔注射4 周(1 mL/kg、1 次/d).取两组壁层腹膜组织,进行HE 染色,并采用Western blotting法检测转化生长因子β1(TGF-β1)、E钙黏蛋白(E-cadherin)、α平滑肌肌动蛋白(α-SMA)表达,结果均提示转分化模型建立成功.采用芯片技术筛选模型组与对照组差异表达lncRNA,应用生物信息学方法分析lncRNA芯片结果,采用RT-PCR法进行验证.结果 芯片筛选结果显示,两组差异表达(≥2倍、P<0.05)lncRNA共757条,差异表达mRNA共1 431条.差异表达倍数较大(>5倍),长度为500~2 000 nt,表达丰度在1 000以上的2个上调和2 个下调的 lncRNA 分别为 ri |4732442J12 |PX00051O23 |2580、 NONMMUT055611、 NONMMUT002253、NONMMUT064302.差异表达lncRNA功能与细胞膜结合蛋白组成、膜蛋白基因转录、炎症防御反应、信号转导通路等有关;差异表达 mRNA 可能参与真核生物翻译过程、膜蛋白合成等途径.模型组 NONMMUT002253、NONMMUT064302相对表达量低于对照组,ri|4732442J12|PX00051O23|2580、NONMMUT055611相对表达量高于对照组(P均<0.05),结果与芯片检测结果基本一致.结论 高糖诱导腹膜间皮细胞转分化小鼠模型中存在差异表达lncRNA,差异表达lncRNA参与腹膜间皮细胞转分化的形成.
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