Ⅰ～Ⅳ登革病毒基因同源性分析及Ⅱ型C蛋白二级结构预测

目的 对登革病毒(dengue virus,DENV)Ⅰ～Ⅳ基因同源性进行分析,同时对DENVⅡC蛋白的二级结构进行预测,为更深入了解DENV 4个血清型间差异及衣壳蛋白C构想.方法 通过DNAMAN分子生物学分析软件和蛋白结构在线预测网站分别对登革病毒基因同源性及C蛋白的二级结构进行预测.结果 在登革病毒基因组同源性中,DENV Ⅰ与Ⅲ同源性最高为72％,发现DENV Ⅰ与Ⅳ同源性最低为67％;在登革病毒基因中,前膜基因prM的的同源性最高为82.5％,非结构基因NS2a的同源性最低为55.28％.在编码capsid的氨基酸中,占组成比例最多的为是精氨酸,可能存在的蛋白结合位点较多.结论 通过基因组同源分析图谱看出Ⅰ～ⅣDENV在结构基因(C、prM、E)之间和非结构基因NS1,NS2b和NS3中的同源性较高,同时蛋白二级结构预测发现DENVⅡC蛋白可能具有分子识别和蛋白骨架等功能.