桐花树叶片的转录组分析
Molecular Plant Breeding（2019）
摘要
为了进一步了解桐花树耐盐的分子机制,本研究采用Illumina HiSeq 2000高通量测序平台对桐花树叶片转录组进行测序,经de novo组装后获得73 721个Unigenes,进一步利用7个公共数据库(NR,NT,GO,COG,KEGG,SwissProt和InterPro)进行比对,注释了50 338个Unigenes.结果 表明,有34 991个Unigenes参与到136条KEGG通路上,其中在花青素和类黄酮合成途径中的Unigenes分别有49个和176个,这些基因可能参与了桐花树应对逆境的调控过程;此外,从转录组序列中搜索到34 509个SSR位点,其中二碱基重复出现次数最多,出现频率为65.75％;从转录组的数据中预测到了2 255个转录因子,分属于58个家族.本研究结果为桐花树的基因功能分析、分子标记开发和遗传多样性研究提供一定的理论参考.
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