基于红掌转录组序列的SSR标记分析与开发

本研究从红掌转录组共32391条unigenes中搜索得到3944个SSR位点，出现频率为12.17%。EST-SSR类型以一、二、三核苷酸重复为主，占总SSR比例的96.29%，其中二核苷重复为主要基序类型，占总SSR的51.01%，AG/CT重复类型出现最多。设计合成的200对SSR引物中有22对引物扩增条带清晰、多态性好，在18个红掌品种中得到有效性验证。结果表明，基于红掌转录组序列的SSR标记开发是可行的，这些EST-SSR的开发可为红掌遗传多样性分析、分子育种等奠定重要基础。