梅EST-SSR特征及其对红叶李的可转移性研究

Qingxiu GONG,Qiufeng NIE,Yongshuo MA, Hao WANG,Yue XING,Hengyue ZHANG,Beibei ZHAO,Yingchun LI,Haibo XIN,Hui FENG,Maoliang WANG,Richen CONG, Jia XU

Journal of Beijing University OF Agriculture（2017）

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摘要

[目的]分析梅EST-SSR特征及其对红叶李的可转移性.[方法]从National Center for Biotechnology Information (NCBI)下载4 589条梅表达序列标签(Expressed Sequence Tag;EST),去除无效碱基后进行拼接和简单重复序列(Simple Sequence Repeat)位点查找;设计引物进行PCR扩增.[结果]获得4 392条unigene,长度为2 420.422 kb;搜索到776个SSR位点,分布在650条EST上,出现频率为14.8％.随机设计了15对引物,以4个红叶李品种基因组DNA为模板,进行了PCR扩增,有9对引物可以扩增到清晰稳定的产物,6对多态性引物共检测出20个位点,平均每对引物可以扩增出3.3条多态性片段,平均多态性信息含量(PIC)为0.8.[结论]SSR位点在梅EST序列上分布频率较高,梅EST-SSR在红叶李中具有较高的多态性,可用于红叶李亲缘关系分析和遗传图谱构建等方面的研究.

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