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五月龄翘嘴红鲌性腺组织小RNA转录谱的分析比较

Jiangsu Agricultural Sciences(2020)

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摘要
采用转录组高通量测序方法,比较分析幼龄翘嘴红鲌精巢、卵巢组织中小RN A转录谱.结果显示,精巢、卵巢的小RNA分布的峰值分别为28、29 nt,与一般物种的22~24 nt有较大的差异;在小RNA库中,经比对注释的比例很低,分别为2.5%、2.1%.在比对注释的斑马鱼miRBase、斑马鱼ncRNA、piRNA、Rfam数据库中,精巢组织中被miRBase数据库注释的比例最高,为1.49%;而卵巢组织中被miRBase和piRNA数据库注释的比例接近,分别为0.94%和0.96%.比较表达量相对较高的共有miRNA分子,均是与胚胎发育相关的分子,且大多是精巢组织的表达量高于卵巢组织,这些miRNA分子在个体发育中可能具有重要意义.初步获得了翘嘴红鲌不同性腺组织的转录谱,为今后进一步分析小RN A在生殖发育中的调控作用奠定了基础.
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