结核分枝杆菌Rv1860T细胞表位预测及分析
Journal of Wuhan Polytechnic University（2018）
摘要
对结核分枝杆菌Rv1860的T细胞表位进行预测及分析.从NCBI数据库得到Rv1860的蛋白质序列,运用Blastp分析Rv1860蛋白与人类蛋白的同源性,NetMHCⅡ预测分析Rv1860的CD4+T细胞抗原表位,SYFPEITHI、NetMHC、BIMAS与IEDB预测分析Rv1860的CD8+T细胞抗原表位.结果表明,Rv1860的CD4+T细胞抗原表位有24条强结合肽段,117条弱结合肽段;CD8+T细胞抗原表位有3条结合性较强的肽段.综合CD4+T细胞和CD8+T细胞抗原表位分析,得到1条优势抗原表位肽段为WLGTANNPV263-271,为进一步临床实验和结核病诊断以及疫苗的设计打下基础.
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